يشغّل التأمين الوطني هيئة تحقيقات تعمل على نطاق قطري وتضم 130 محققاً.
محققو التأمين الوطني لديهم التعليمات بإيجاد والكشف عن أعمال غش ومنع استغلال أموال التأمين الوطني استغلالاً سيئاً. يجد المحققون الأشخاص الذين يتلقون مخصصات بالغش من خلال عرض معطيات كاذبة, ويعملون ضد أصحاب عمل مشغّلين يتهربون من دفع رسوم التامين عن العاملين لديهم وذلك مخالف للقانون.
يُستخدم في قسم التحقيقات مخزون المعلومات الموجود لدى مؤسسة التأمين الوطني ويتم تفعيل عمل استخباراتي يتلقى معلومات من جهات عديدة في الجمهور, هدفها كشف أعمال الغش ضد التأمين الوطني.
محققو مؤسسة التأمين الوطني مخولون بتنفيذ تحقيقات وفقاً لأوامر المراحل الجنائية. نتائج التحقيقات وشهادات تشير الى شكوك بالغش يتم تحويلها لتقديم لوائح اتهام بواسطة الوحدة القطرية للتحقيق في الجرائم المالية التابعة لشرطة إسرائيل.
قُدمت حتى الآن مئات لوائح الاتهام ضد مطالبين تلقوا مخصصات بالغش. العقوبات التي فرضتها عليهم المحاكم تشير الى الصرامة التي ينتهجها الجهاز القضائي إزاء هذه المخالفات لقانون مؤسسة التأمين الوطني.
في مؤسسة التأمين الوطني يؤمنون بأن وجود قسم تحقيقات قعّال ويجري التحقيقات, واستنتاجاته تؤدي الى تقديم لوائح اتهام, سيؤدي في نهاية المطاف الى فرض العقوبة على المخالفين للقانون وخلق رادع امام اولئك الذين يحاولون تلقي مخصصات بالغش.